Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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SPTSSAQ969W0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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SPTSSAQ969W0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SPTSSAQ969W0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SPTSSAQ969W0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SPTSSAQ969W0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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