Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms