Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX9

TPCN2, Two pore calcium channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN2Q8NHX9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPCN2Q8NHX9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms