Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms