Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms