Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms