Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAMK4Q16566 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms