Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms