Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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