Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms