Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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