Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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