Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms