Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLOD1Q02809 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms