Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms