Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms