Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNA2P51530 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNA2P51530 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNA2P51530 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms