Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms