Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms