Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms