Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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