Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms