Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOP08100 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms