Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13BP05160 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13BP05160 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms