Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEBLO76041 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEBLO76041 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEBLO76041 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEBLO76041 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NEBLO76041 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEBLO76041 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEBLO76041 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEBLO76041 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms