Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms