Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG3Q9Y2Y8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms