Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms