Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms