Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms