Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms