Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms