Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms