Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms