Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms