Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms