Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms