Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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