Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMD5Q16401 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms