Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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