Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.2 ms