Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms