Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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