Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms