Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA1Q13131 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms