Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF2Q12947 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF2Q12947 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF2Q12947 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF2Q12947 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF2Q12947 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF2Q12947 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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