Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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