Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP160Q12769 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms