Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms