Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms